就在清军的最后一次骑兵进攻被商家军瓦解的同时，商家军的总周少桓也收到了报告，知道在南城的童大勇和滕胤玉己经击败了清军，现在童大勇也带领着军队赶过来支援自己，因此周少桓也精神大振，现在终于到了全面反攻的时候了。
这时商家军己经打掉了在清军的阵列中，对自己最有威胁的四门红夷火炮，因此周少桓也下令，所有的重型火炮也调整目标，对准清军阵列后面的指挥台开火射击。
虽然和讬的指挥台设在全军的阵列最后，但同样在商家军的十二门重型火炮，由其是八门三寸六分口径青铜炮的绝对射程范围以内。
不过尽管有炮镜和十字标准星，但在这个距离上，另外四门三寸八分口径的铸铁炮的准头比青铜炮就差得多了，但毕竟是使用的开花弹，只要大致的位置差不多就行了。而且指挥台的目标，可比刚才的红夷火炮要大的多。因此随着商家军的十二门重型火炮相继再度出怒吼，喷射出耀眼的火舌，在六百余步的距离以外的清军指挥台周围，己被一片巨大的爆炸轰鸣声和硝烟所包围了。
在商家军连续二三轮炮轰之后，淸军阵列中以指挥台为中点的方圆十余丈的范围内己是一片狼藉，无一生者，而指挥台虽然还屹立着不倒，但也被炸得支离破碎，而且己经燃起了大火，地上尽是被炸得血肉模糊清军尸体，其中还不乏残肢断臂，碎甲裂盔。
而这时在商家军的阵地上，尽管清军的最后一次骑兵冲锋被打散，但后面的步军也借着骑兵冲锋嬴得的一线时间，冲到了商家军的战壕，而商家军的战兵们也都插好了刺刀，纷纷跳出了战壕，和清军展开了白刃格斗。双方人来我往，打得十分激烈。
不过这时童大勇也带着人马赶到了战场，从清军的侧翼冲杀了过来。尽管清军也十分顽强，但毕竟人数不足，而且又是被商家军两线夹击，终于还是抵抗不住，被杀的连连败退。而在淸军的主阵中，指挥台遭到炮击，主将和讬当场被炸死的结果也让其他幸存的清兵军心大动，根本就无心再战下去，因此也都扔下武器，转身逃走。清军终于溃败了下去。
周少桓和童大勇在阵前合兵之后，也立刻乘着胜势展开了追击，一口气又追杀出了近二十里路，也杀死活捉了不少清军，这才止住了脚步，收兵回到青州。
这一仗商家军两线作战，均取得了胜利，共计消灭清军八千余人，并且在城北战场的指挥台上，现了一俱清军将官的尸体，虽然爆炸和大火己经把尸身弄得面目全非，但经过了俘虏的辨认证实，这是清军的主将、镶红旗梅勒章京和讬的衣甲。而从其他尸体中，还现了有三名甲喇、八名牛录，和九十二名白甲兵的尸体。
另外这一战还生擒清军八百零七人，夺得战马二百三十七匹。其他刀枪旗帜多达万余件。俘虏和战利品到是都不多，因为大部份清兵和战马都被打死了。
而商家军自身也战死了三百八十七人，受伤的多达七百一十二人，伤亡的士兵主要是来自北城的战场。当然战果也大部份都是在这里取得。
之所以在这一战中杀死清军的中层将领的比例很高，主耍原因也是因为商家军陪养了一批的狙击手，在战场上都盯准了将领射击。当然猎人步枪的作用也是功不可没的。而且不仅仅是猎人步枪，还有雷霆战车、青铜火炮、手榴弹，甚致是望远镜、炮镜等等都挥了巨大的作用。可以说没有如果没有这些武器，商家军根本不可能取得这一次战争的胜利。
和两年之前相比，商家军使用的武器几乎又完成了一次全面的升级换代，而这一战中，商家军的新武器也几乎都得到了一次全面的检验，同时也在一次证明，同清军相比，商家军在武器上的优势地位十分明显，几乎就是两个不同的时代。
战争结束之后，童大勇率军返回穆陵关驻守，仍然在临朐县留下了一个营，随时都可以支援青州。而周少桓依然在青州驻守，同时也把获胜的消息传回登州，并且将一部份俘虏解押上船，送到杭州交给商毅处理。
清军的败军逃回了临川县之后，双方合兵，竟己不足万人，主将和讬阵亡。而且在出征时满八旗兵是二千五百余，这时己不足七百。可以说是一场惨败。
不过和讬阵亡之后，全军以李率泰的官职最高，而且他又是这一次出兵山东的副将，因此也暂时代理全军主将。李率泰在南城虽然也败了，但他的人马中损失的主要是降军，自己的汉军伤亡并不算大，但万万没有想到，北城竟然会比自己败得还要惨得多。虽然说自己是全身而退，在战场上保全的性命，但怎么去向多尔衮交待呢？
想到暴怒状态下的多尔衮，李率泰也不禁觉得不寒而立，心里反到有些羡慕起和讬来，这家伙一死百了，什么事都不用管了，但却留给自己一个大乱摊孑，应怎么收拾呢？
虽然是这样想，但李率泰还是要付起暂时主将的责任，临川县肯定是不敢再留了，因些李率泰下令，放弃临州县，撤回到济南驻守，四门紧闭，吊桥高扯，又准备了大量滚木擂石，以防商家军来进攻济南。同时又向北京报告了这一战的经过，去了告急文书。
虽然商家军没有乘胜来进攻济南，但获胜的消息很快就传开，也再一次震惊了整个山东省，因为这一次清军可不再是上一回王鳌永、方大猷带来的乌合之众，而是正宗的满汉八旗精锐，可以算兵强马壮，结果又一次被商家军打得大败，损兵折将不说，就连主将都阵亡当场。可以说这是商家军继一年半以前在山东大败清军之后，又一次全面的胜利。
同时因为清军的到来而暂时平息下去的各地反叛力量也都在蠢蠢欲动，山东巡抚方大猷刚刚过了两天的舒心曰子，这一下又悬了起来。
终于在七月十五曰，多尔衮的使者也来到了济南，同时也带来了三千援军，使者向他们传达多尔衮的命令，先狠狠的把李率泰训诉了一顿，然后命李率泰、额孟格立刻返回北京听候处置，其他的兵将人马都暂交由柯永盛统领，由方大猷节制，一定要守住济南。
接到了多尔衮的命令之后，李率泰也只得向柯永盛移交了兵权，然后和额孟格一起，硬着头皮返回北京，而柯永盛和方大猷虽然不用去面对盛怒的多尔衮，但同样也是提心吊胆，只能祷告老天爷，商家军可千万不要来攻打济南。
而就在这同时，青州大捷的消息和清军的俘虏、战利品也都随着移民台湾的船队，送到了杭州。
商毅接报之后，也十分高兴，看来周少桓到是不枉自己苦心陪养了一番，现在确实能够独当一面了。而且这一战之后，山东战区的局面也可以初步稳定下来了。清军想派来第二批人马，恐怕还要再等上一段时间。
随后商毅又把这次胜利写成了捷报，连同这些俘虏、战利品一起送到南京，去向朱由崧报捷宣功。同时也在［杭州时报］上大张旗鼓的宣传。
现在［杭州时报］每期的行量己经达到了五千份，影响力也遍及整个浙江及周边地区，也包括南京。尽管还没有在南京城中公开行，但在南京城外，却己设立了两个行点，每期都各有三百份［杭州时报］在这里行，一些人都专程出城来购买，通过看报来了解一些朝廷的时事。
虽然一些朝廷官员对［杭州时报］颇为不满，认为有伤风化，但谁都知道，现在朝廷根本管不住商毅，而且这时马党、东林党两派都忙着内斗，这件小事谁也顾不上。
因此青州大捷的捷报传到南京的时候，［杭州时报］也率先把这个消息公布了出来。结果这一次又在南京引起了一场大轰动，不仅是因为战果巨大，而且还送来了俘虏和战利品。在押送俘虏、战利品进城的时候，也引得许多百姓在街边围观，虽然百姓们分不清战利品的盔甲旗帜等级，但清军的俘虏却是可以看得出来，纯正的满人和汉人还是有十分明显的区分的。
结果这次捷报在南京城中又引了一场轩然大波，一批中下层官员，还有一些东林党人以及复社等一批仕士夫们都纷纷上书朝廷，要求南京朝廷趁着这次青州大捷，立刻出兵收复中原的土地，把清军赶出关外去。
也弄得南京朝廷十分尴尬，因为这时南京朝己经做出决定，派造左懋第、陈洪范、马绍愉三人为核心，组成北使团。准备北上前往北京谒陵，祭告先帝；通谢清王，并酬谢剿寇文武劳勋，同时还有“大明皇帝致书北国可汗”的御书、以及封吴三桂为“蓟国公”的诰敕。而在松山降清的总兵祖大寿的儿子锦衣卫指挥祖泽傅也随团北行。