三月，清军平西王吴三桂一路大败明军总兵杜子香，进占合州，并于次月攻陷重庆。
吴三桂遂以重兵镇守重庆，严防夔东十三家，随即与李国翰率军取道綦江，于四月二十五日进逼三坡、虹关、石台关一带。此间山高路窄，上则摩于九天，下则坠于重渊，人皆覆涩，马皆钉掌，节节陡险，一夫可守。
明军主将刘镇国率军五千及数头战象在此扼险坚守，却被吴三桂一举击溃。旋即清军乘胜追击，又在开州击退明军总兵梁亦英，迅速占领了三坡、遵义。
得到前线节节败退的消息后，定国立刻命令全军向安庄一线收缩，并往安庄派去援军巩固防线。
与此同时，中路清军在洛托、洪承畴的统领下于月底抵达贵阳，大败明军马进忠部，马进忠弃城而走，贵阳旋即易手，贵州巡抚冷孟鉦被擒，不屈而死。
就在清军步步紧逼之时，文秀的病情也愈发沉重了。由于文秀始终不肯与定国见面，无奈之下，定国只得让金维新代自己前去探望。
金维新抵达蜀王府，在世子刘震的带领下来到了文秀的卧室，刚一进屋就看见文秀正平躺在榻上，面容憔悴，大口地喘着粗气，时不时还伴随着一阵咳痰声。
万万没想到，仅仅数月不见，一向温文儒雅的文秀竟会变成如此模样，金维新当即泣不成声地拜倒在地，痛心疾首地说道：“殿下须当好自珍重身体，争取早日康复，重返前线，带着将士们继续杀鞑子！”
文秀勉强睁开眼睛，见是金维新，不禁一声叹息道：“金先生快快请起，本王怕是大限已至，恢复大明江山的重担，将来可就全都压在晋王身上了！”
听文秀这么说，金维新忍不住哽咽道：“如今山河破碎至此，殿下怎可舍我等而去？切莫再胡思乱想，您正值壮年，必定能够康复起来！”
文秀却是艰难地摆了摆手，强撑起一抹笑意：“本王的身体，本王自己清楚。吾已是病入膏肓，难以周全，怕是要先走一步，在地下等着晋王克复中原的喜讯了。”
话说到此，文秀已是上气不接下气，一旁的御医见状连忙走上前来，对着金维新施礼道：“金大人请回吧，蜀王殿下需要休息了。”
金维新刚刚从座椅上起身，却见文秀伸手指向窗台旁的桌案，小声说道：“金先生，劳烦将本王放在桌上的奏折交给皇上。”
等金维新将奏折收好，文秀方才继续说道：“本王还想再见一见二哥。”
“殿下稍等片刻，在下这就去请晋王过来！”金维新发现文秀气若游丝，知道他怕是挨不过今日了，连忙转身快步离开蜀王府，飞身上马直奔晋王府，将文秀的情况一五一十地禀报给了定国。
定国闻讯大吃一惊，知道文秀命不久矣，这是要交代后事了，心中大恸，赶紧喊来香莲，翻身跃上“二斗金”，载着她飞驰赶到了蜀王府。
进门见到文秀这般情景，香莲忍不住失声大哭道：“哥，这才几个月不见，你到底是怎么了？”
定国强忍着泪水，紧紧攥住文秀冰凉的手：“三弟，你我兄弟刚刚割襟结盟，可不能就这样弃我而去啊！”
听到定国和香莲的呼喊，文秀艰难地睁开眼睛，微微抬了抬手，示意旁边的人全都退下，并带上了房门。
直到这时，文秀方才缓缓言道：“二哥、小妹，你们可算来了！这几日，每我当闭上眼，脑海中浮现的全都是咱们兄妹三人小时候在一起的美好时光，可如今却是恍若隔世！若有来生，咱们还做兄妹！”
文秀的话让定国的泪水瞬间如决堤的洪水，一发不可收拾，只见定国垂泪言道：“三弟，都怪哥哥猜忌过重，使你伤心至此，是哥哥对不住你！你且多多保重身体，待大病痊愈之时，咱们兄弟再一起上阵，与鞑子决一死战，以报国仇家恨！”
“二哥莫要安慰于吾，吾自随义父举事以来，早就料到会有这么一天，一切都是命数使然，二哥、小妹不必如此悲伤！待吾死以后，大明朝就只剩下二哥你一人独木支撑了，望二哥多多保重身体，不要步吾之后尘。”文秀轻轻拍了拍定国的手背，满脸的不舍和留恋。
定国早已泣不成声：“想当年，咱们兄弟四人共同入滇，如今四弟战死，大哥降清，仅剩下你我兄弟二人唇齿相依，本该同舟共济，可哥哥却这般猜忌于你，真是悔不当初啊！”
提起孙可望，文秀心中顿时充满了懊恼，长叹一声道道：“如今大哥已是形同陌路，对你我二人更是恨之入骨。吾其实从没想过要取他的性命，只希望他能够痛改前非，可没想到大哥居然选择降清，当年义父正是死于鞑子之手，大哥今日却认贼作父，此举必遭天谴矣！”
定国正欲开口说话，却被文秀把话打断，垂泪言道：“二哥，今日之难皆因大哥引狼入室所致，清军如今从陕西、湖南、两广三路同时进攻，我军危矣！愚弟已是力不从心，二哥务必要想出退敌之策，否则社稷毁坏，亡国灭种，皆我兄弟之过也！”
定国点头安慰道：“三弟，哥哥我哪怕只剩一口气在，也断然不会让满鞑子轻易得逞！你病得如此之重，却还为国事操心，哥哥我实在是肝肠寸断啊！”
文秀说了这么久话，早已是精疲力尽，只见他强撑着一口气艰难地继续托付道：“我命不久矣，二哥还须亲自前往贵阳督军，否则贵阳陷落，滇都亦不能独存！此外还应当派一员上将提一支劲旅，联合夔东十三家镇守四川，决不能让清军轻易从汉中南下入川！只有全力经营四川，将此做为他日北进中原的根基，大明复兴方有指望！待我死后，愚弟家眷尽皆托付二哥了，尤其是犬子刘震不才，还须劳烦二哥教导成人，早日为国效力。”
定国难过地点了点头：“为兄知道了，你就放心吧。”
文秀于是拼尽全身最后的力气，紧紧拉住定国的手，高呼一声：“收复河山……”旋即，永远闭上了眼睛。
永历十二年四月二十五日，一代名将刘文秀于滇都病逝，纵观他的一生，早年追随张献忠转战南北，后归附大明，忠心报国，功勋卓著，可惜时运不济，空有一身本事，却始终没能得到施展的机会。
定国握着文秀的手，久久不肯松开，直到手心得温度渐渐变得冰凉，脑海中不停浮现起当年的金戈铁马，回想起兄弟四人当年谈笑风生的情景，如今就只剩下自己一人苦苦独撑危局。
临终之前，文秀曾上遗表云：“虏兵日逼，国势日危，请入蜀以就十三家之兵。臣有窖金一十六万，可以充饷。臣之妻子族属皆当执鞭弭以从王事。然后出营陕、洛，庶几转败为功。此臣区区之心，死而犹视者也。“
永历帝在看完文秀遗疏之后，心中不禁感慨万千道：“蜀王于病危之时，对江山社稷依旧萦绕于心，不但捐赠其全部积蓄窖金，更是号召子孙尽忠报国，共赴国难，可谓肝胆可昭日月，真乃忠勇之士也！”
定国听了永历帝之言，亦是心中羞愧，后悔当初猜忌之心，深感文秀胸怀坦荡，感慨言道：“蜀王乃真英雄也！吾自愧不如，请皇上治罪。”
永历帝对于文秀的死讯也是悲恸不已，更是辍朝三日，谥曰:“忠”字，葬于安宁曹溪寺右山。
经过秦王之乱，蜀王病故这一系列打击，永历朝中人心惶惶，愈发死气沉沉，望着文秀的棺椁入土，定国更是心如潮涌，一种不祥之感瞬间蔓延遍全身。
五月初二日，孙可望在麻勒吉等的护送下来到了北京城，顺治帝命和硕简亲王济度、和硕安亲王岳乐带领公、侯、伯、梅勒章京、侍郎等大批高官显爵出城相迎，场面隆重异常。
围观人群中，有万历朝户部主事方大铉之子，南直隶桐城大族子弟方文正在其中，他亲眼看到孙可望竟得到了清廷如此厚待，忍不住赋诗言道：“南海降王款北庭，路人争拥看其形。紫貂白马苍颜者，曾搅中原是杀星。”
次日，顺治帝亲自于太和殿召见孙可望，并在十天之内赐宴多达三次，赐银两次共一万二千两，此外赐府第、赐蟒袍、朝衣、缎匹等不可计数。
一时间，孙可望竟从丧家之犬一跃成为清廷中红极一时的大人物，这令孙可望不禁诚惶诚恐，受宠若惊。念及八年前自己举云南全省之地向漂泊动荡的主动示好，永历君臣却连一个秦王的封爵都是百般刁难，心中更是唏嘘不已，感慨良多。
当月，吴三桂又于开州击败了明军杨武部，水西、酉阳、蔺州诸府全部沦陷。
六月十九日，坐镇滇都的定国在金维新的陪同下登上滇西鸡足山进香。
宾川鸡足山，苍崖万仞，翠微千里，猿踞揉攀，高峻险拔，定国登上鸡足山，被其美景陶醉其间，不禁流连忘返。就在此时，附近石钟寺方丈行远大师率僧众迎出寺门，毕恭毕敬地说道：“老衲不知晋王驾临，未曾远迎接，请晋王治罪！”
定国连忙上前，恭恭敬敬地作揖言道：“方丈客气了，您是有福之人，在此山之中修炼，真是恍若仙境！”
行远大师连忙接过话题，笑着说道：“旧闻晋王尽忠报国，素有善缘，今日一见果然名不虚传。”
定国在行远大师的陪同下步入石钟寺，环顾一眼四周，忍不住感慨道：“此寺看来已年久失修了！”
行远大师无奈地说道：“鄙寺也曾打算修葺，奈何多年战乱不息，徭役赋税繁重，实在是力不从心也！”
定国听后，沉默了许久，待至进香完毕，方才让行远大师取来笔墨纸砚，当场发布谕令道：“晋王李令谕：照得鸡足名山，滇西形胜，本藩西征既捷，便道进香，蓬麓跻巅，游览已悉。惟是峰壑幽深，刹院不无倾圮，询之僧众，咸称近苦差徭。因念其供奉香灯，出于常住，寺僧别无活计，杂派宜于从宽；即或增加田粮，有司当为减豁。至于本山度牒，援纳已经通免，自后或有奸胥、积棍，播害滋端，过往官兵，搜求践踏，许尔各寺僧人，指名启究，永为遵守，俱勿违！此谕。”
至七月，卓布泰一路清军，则自黎平攻入了贵州独山，至此，清军三路大军尽皆集结于贵州，准备大举进犯云南。